Sejak menyamar sebagai Hong Jang Mi, Hong Keum Bo (Park Shin Hye) tidak hanya dituntut beradaptasi dengan lingkungan kerja yang asing dan penuh tekanan di drakor Undercover Miss Hong. Ia juga harus merangkai potongan-potongan kecil informasi yang tersebar, terselip di balik kebiasaan kantor, relasi personal, hingga kebijakan perusahaan yang tampak sepele.
Setiap potongan puzzle yang ia temukan perlahan mengubah arah misi, dari sekadar penyamaran menjadi upaya membongkar jaringan kejahatan yang jauh lebih besar. Ada lima potongan puzzle krusial yang berhasil dipecahkan Hong Keum Bo, dan masing-masing membuka lapisan baru konflik dalam Undercover Miss Hong.
