Jun Ji Hyun menikah dengan seorang Choi Jun Hyuk yang merupakan temannya di masa sekolah pada tahun 2012, sejak menikah Jun Ji Hyun masih tetap aktif dalam membintangi drama dan film.
Aktris populer di Korea ini terakhir kali membintangi drama bersama dengan aktor Lee Min Ho yang berjudul Legend Blue of The Sea tahun 2016 yang lalu, dan belum memutuskan mengambil proyek baru dikarenakan Jun Ji Hyun tengah mengandung.
Juni tahun 2017 agensi Jun Ji Hyun mengkonfirmasi bahwa artisnya tengah mengandung anak keduanya, setelah berselang 1 tahun melahirkan anak pertamanya pada bulan februari tahun 2016.
Jun Ji Hyun dan sang suami yang sama-sama memakai baju casual terlihat mengunjungi pusat perbelanjaan, momen langka ini pun langsung diabadikan oleh seorang fans dengan mengambil gambar pasangan tersebut dari belakang, meskipun pengambilan gambar dari belakang terlihat Jun Ji Hyun sangat menikmati waktunya bersama suami tercinta.
Semoga sehat selalu dan persalinannya lancar, ya Ji Hyun!