Seperti perbaikanlain, biaya servis ECU sangat bervariasi tergantung kerusakan dan tipe mobilnya. Jika kerusakannya ringan, biayanya akan makin sedikit. Selain itu, ada juga beberapa model mobil yang biaya servisnya jauh lebih murah jika dibandingkan dengan pesaingnya. Namun, jika digeneralisasi biaya servis ECU mobil berkisar antara Rp700 ribuan hingga Rp3 jutaan.
Pertama, biaya servis ECU mobil yang terkena banjir akan lebih mahal daripada perbaikan karena usia yang sudah tua. Berikutnya, servis ECU mobil pabrikan Jepang (Toyota atau Honda), umumnya lebih murah daripada unit buatan Eropa (BMW, Land Rover, atau Ferrari).
Secara spesifik, umumnya servis ECU mobil Jepang sekitar Rp700 ribu—2,5 juta. Untuk mobil produksi Eropa harga servisnya bisa lebih mahal sekitar Rp200 ribu—Rp400 ribuan.
Biaya servis juga diambil dari harga ECU mobil itu sendiri. Umumnya, biayanya sekitar 25 persen dari harga ECU baru. Contohnya, harga ECU Toyota Camry sekitar Rp7 jutaan. Jadi, biaya servis ECUnya ada di angka Rp1,7 juta—Rp2 jutaan. Adapun harga ECU mobil Eropa bisa mencapai Rp10 jutaan. Alhasil, biaya servisnya tembus Rp3 jutaan.