Menjelang akhir A Shop For Killers 2, berbagai kejadian mulai memunculkan pertanyaan baru tentang nasib Jeong Jin Man (Lee Dong Wook), Jeong Ji An (Kim Hye Jun), Murthehelp, dan Babylon. Beberapa informasi yang terungkap membuat hubungan antar karakter serta tujuan masing-masing pihak semakin sulit ditebak. Kondisi tersebut kemudian memunculkan sejumlah teori mengenai arah cerita menjelang ending.
Teori-teori ini muncul dari petunjuk yang diberikan melalui tindakan para karakter dan berbagai rahasia yang belum sepenuhnya terungkap. Terutama setelah serangan Babylon terhadap Murthehelp dan rencana yang telah disiapkan Jeong Jin Man. Berikut tujuh teori yang muncul menjelang ending A Shop For Killers 2.