Yoon Yi Jun (Im Si Wan) merupakan karakter utama drakor Love in Disguise. Ia adalah konglomerat yang dituduh sebagai pembunuh. Di sisi lain, Kang Jae Hee (Seol In Ah) menyamar jadi sekretarisnya untuk menyelidikinya.
Dalam drakor ini, Yoon Yi Jun digambarkan sebagai cowok dengan pesona yang unik. Ia sensitif dan tampak rapuh, tapi kompetensinya sebagai calon pewaris perusahaan besar tak perlu diragukan. Pesona tak biasa ini bikin Yoon Yi Jun terlibat dengan beberapa karakter cewek. Siapa saja?
Kang Jae Hee selama ini sering salah dikenali sebagai cowok karena gayanya yang boyish, rambutnya yang pendek, dan ketangguhan fisiknya. Ia juga jago bertarung dan bisa melawan banyak lelaki. Karena itu, tak sulit baginya untuk menyamar menjadi cowok agar bisa menjadi sekretaris Yoon Yi Jun untuk mencari bukti atas kasus pembunuhan.
Meski sikapnya tegas dan maskulin, Kang Jae Hee mudah baper saat ada cowok yang bersikap baik padanya. Bahkan ia juga malu dan gelagapan saat melihat Yoon Yi Jun bertelanjang dada. Di sisi lain, Yoon Yi Jun sempat mengira dirinya gay karena tertarik pada Kang Jae Hee yang mengaku cowok. Namun, saat identitas asli Kang Jae Hee sebagai cewek terungkap, Yoon Yi Jun akan merasa sangat senang.
Han Eun Young (Jung Yoo Min) bekerja sebagai salah satu sekretaris Yoon Yi Jun yang menjabat sebagai Direktur Pelaksana Taekang Group. Di episode 1, ia menghadapi nasib nahas karena berakhir dibunuh. Sementara itu, Yoon Yi Jun menjadi tersangka utama.
Dari beberapa potongan adegan, terlihat ada rahasia antara Yoon Yi Jun dan Han Eun Young. Selain itu, ada rumor bahwa Han Eun Young bukan cuma pegawai, melainkan kekasih gelap Yoon Yi Jun. Meski begitu, belum terungkap apakah rumor ini benar atau tidak.
Lee Si A (Choi Hee Jin) Direktur Naon Art Center. Sebagai sesama dari keluarga konglomerat, ia mengenal Yoon Yi Jun sejak kecil. Meski sebetulnya seumuran dengan Yoon Yi Jun, ia sering memanggil cowok itu dengan sebutan "oppa". Tujuannya untuk menjahili Yoon Yi Jun yang tak suka dipanggil begitu.
Kedua pihak keluarga memutuskan Yoon Yi Jun dan Lee Si A untuk menikah demi kepentingan bisnis. Keduanya pun setuju atas perjodohan ini dan akhirnya bertunangan meski mereka aslinya sama-sama tidak punya perasaan lebih terhadap satu sama lain.
Ketiga karakter di atas memiliki loveline dengan Yoon Yi Jun, baik karena rumor ataupun perjodohan. Namun, Yoon Yi Jun hanya tertarik kepada Kang Jae Hee yang maskulin dan sering menyelamatkannya di Love in Disguise.