Drama Korea Undercover High School menghadirkan seorang anggota NIS (National Intelligence Service) Korea Selatan bernama Jung Hae Seong (Seo Kang Joon) yang menjalankan misi rahasia. Ia ditugaskan jadi siswa di SMA Byeongmun. Kabarnya, terkubur emas senilai 800 juta dolar di dalam sekolah itu.
Selama menjalankan misi, Jung Hae Seong melalui berbagai rintangan. Ia bertemu banyak pihak yang ternyata punya keterkaitan kuat dengan misi yang ia jalani. Belum lagi fakta bahwa ayahnya yang juga anggota NIS 'hilang' setelah gagal menjalani misi yang sama dengan Hae Seong.
Hal ini memicu spekulasi penonton mengenai karakter tak terduga yang terlibat masalah itu. Siapa saja karakter yang diduga terlibat dalam kasus ini? Berikut penjelasannya.