Berbicara mengenai SS atau secara khusus Waffen-SS ,maka tidak salah lagi untuk melihat mereka berbeda dengan Angkatan Bersenjata Jerman yang dikenal dengan nama Wehrmacht. Keduanya walaupun memiliki tugas yang sama yaitu mempertahankan Jerman dari serangan musuh, tetapi ada banyak perbedaan yang jarang diketahui oleh banyak orang.
Wehrmacht adalah tentara reguler Angkatan Bersenjata Jerman yang berada di naungan Pemerintah Jerman. Sedangkan Waffen-SS adalah Pasukan Khusus atau Elit Jerman yang dimana mereka bertindak atas perintah langsung dari Adolf Hitler.
Dalam pertempuran di berbagai front, awalnya Wehrmacht-lah yang menguasai jalannya pertempuran bersama jenderal-jenderal terbaiknya. Namun seiring berjalannya perang, Hitler yang mulai terlibat secara langsung dalam penentuan gerak dan aksi militer membuat koordinasi Wehrmacht terpecah belah. Hitler yang semakin sulit mempercayai jenderal-jenderalnya di Wehrmacht akhirnya mengirim Waffen-SS ke pertempuran di mana ia memiliki kontrol penuh atas segala tindakan.
Ketika di masa-masa terakhir Jerman dalam Perang Dunia ke-2, perselisihan antara Wehrmacht dan Waffen-SS pun tidak bisa dihindari yang akhirnya membuat persatuan Militer Jerman semakin retak. Keretakan ini akhirnya membuat kedua cabang kemiliteran tersebut saling tembak-menembak ketika ada hal yang dianggap salah satu pihak tidak pantas untuk dilakukan. Seperti menembak tawanan yang ditentang keras oleh Wehrmacht dan mundur ataupun menyerah dari pertempuran meskipun tidak ada lagi yang dapat dilakukan untuk bertempur di mana hal ini sangat ditentang oleh Waffen-SS.
Wehrmacht pun sempat bekerjasama dengan Pasukan Sekutu dalam Pertempuran untuk Kastil Itter pada tanggal 5 May 1945 dimana Pasukan Wehrmacht yang menyerah kepada Sekutu ikut membantu Sekutu mempertahankan Kastil Itter yang pada saat itu ingin direbut oleh Pasukan Waffen-SS. Kedatangan Waffen-SS ke Kastil Itter adalah untuk membunuh seluruh tawanan perang dan para pembelot Jerman. Pertempuran untuk Kastil Itter yang berlangsung selama satu hari pun dimenangkan Pasukan Sekutu dan Wehrmacht ketika bala bantuan Sekutu yang ditunggu-tunggu datang.