Dengan jumlah populasi yang hanya tercatat 12-15 ekor pada Maret 2018, Vaquita menjadi mamalia laut yang paling terancam kelangsungannya. Mamalia laut langka ini diperkirakan akan punah dalam beberapa tahun ke depan.
Berbagai aktivis dan organisasi pemerhati lingkungan di seluruh dunia telah melakukan tindakan konservasi, tetapi populasi mamalia laut terkecil ini terus mengalami penurunan.
Ancaman datang dari aktivitas penangkapan ikan ilegal hingga kerusakan habitat. Punahnya Vaquita akan mengakibatkan dampak ekologis signifikan pada habitat aslinya di Teluk California.