still cut film Godzilla Minus One (dok. Toho Studios)
Setelah perang berakhir, Koichi kembali ke Tokyo. Namun, kehidupannya tidak lebih baik juga. Rumahnya hancur akibat pengeboman dan orang tuanya meninggal. Jepang dalam kondisi memprihatinkan setelah kalah perang. Di tengah kehancuran itu, dia bertemu dengan Noriko Oishi yang bernasib sama. Noriko saat itu sedang mengasuh bayi yatim piatu bernama Akiko. Keduanya memutuskan untuk membangun keluarga kecil dari pertemuan tersebut.
Beberapa waktu kemudian, Koichi berlayar dengan sejumlah mantan personel militer untuk membersihkan ranjau yang masih tertinggal di perairan Jepang setelah perang. Di sini, Koichi bertemu dengan beberapa karakter penting seperti Seiji Akitsu, Kenji Noda, dan Shiro Mizushima. Dalam perjalanan itu, mereka kembali diserang Godzilla.
Ternyata, monster yang sebelumnya menyerang Pulau Odo telah mengalami mutasi akibat pengujian nuklir Amerika Serikat. Godzilla kini memiliki ukuran dan kekuatan yang jauh lebih mengerikan. Bahkan tubuhnya bisa sembuh sendiri ketika terluka. Salah satu kemampuan terbesarnya adalah mengeluarkan atomic breath yang mampu meratakan wilayah luas dalam sekejap. Jepang kocar-kacir, baru kalah perang dan gak punya kekuatan militer yang cukup buat menghentikan serangan Godzilla.