Kang Hae Jun (Bae Hyun Sung) dalam drakor Family by Choice dikisahkan memiliki kehidupan yang malang. Sejak kecil, ia ditinggalkan oleh ibunya dengan orang yang bukan keluarganya. Ia tumbuh bersama Yoon Joo Won (Jung Chae Yeon) yang menganggapnya sebagai saudara.
Tanpa tahu alasan dirinya ditinggalkan, Kang Hae Jun hanya berharap jika suatu saat ia bisa bertemu ibunya kembali. Seiring berjalannya waktu, ternyata kehidupannya malah semakin bertambah rumit. Sebab, hubungan Kang Hae Jun dengan keluarga kandungnya sangatlah rumit. Berikut kerumitan hubungan yang terjadi antara Kang Hae Jun dengan keluarga kandungnya di drakor Family by Choice.