Seiring tuntasnya laga-laga fase grup, total sudah ada delapan tim yang memastikan diri melaju ke perempat final. Mereka adalah PSIS, Barito Putera, Persija, PSM, Persebaya, PSS, Persib, dan Bali United.
Berdasarkan regulasi, nantinya juara Grup A akan bertanding melawan runner-up Grup B, sedangkan juara Grup B bertanding melawan runner-up Grup A. Begitu juga juara Grup C bertanding melawan runner-up Grup D, sedangkan juara Grup D melawan runner-up Grup C. Babak perempat final akan menggunakan sistem gugur.
Sejauh ini, baru Stadion Kanjuruhan yang dipastikan bakal jadi venue perempat final, untuk laga yang mempertemukan tim-tim yang lolos dari Grup A dan B. Sedangkan venue untuk tim yang lolos dari Grup C dan D, masih belum ditentukan. Opsinya antara Maguwoharjo dan Si Jalak Harupat.
"Ya, keduanya jadi opsi (Stadion Si Jalak Harupat dan Stadion Maguwoharjo). Bisa saja dua-duanya dipakai untuk babak perempat final," ujar OC Piala Menpora 2021, Akhmad Hadian Lukita.
Berikut adalah bagan dan jadwal dari perempat final Piala Menpora 2021
Jumat, 9 April 2021 - PSIS Semarang vs PSM Makassar (Malang, 18.15 WIB)
Sabtu, 10 April 2021 - Persija Jakarta vs Barito Putera (Malang, 18.15 WIB)
Minggu, 11 April 2021 - PSS Sleman vs Bali United (tempat belum ditentukan, 18.15 WIB)
Senin, 12 April 2021 - Persib Bandung vs Persebaya Surabaya (tempat belum ditentukan, 18.15 WIB)