Paul Allen didiagnosis mengidap kanker pada tahun 1982. Namun saat itu, dia dapat kembali pulih hanya dalam jangka waktu beberapa bulan setelah mengikuti terapi radiasi.
Setelah itu, dia pun kembali aktif berkarir. Paul Allen mencoba menjadi pengusaha, inevstor, dan filantropi. Di tahun 1986, dia mendirikan Vulcan, yakni perusahaan yang bergerak di bidang peminjaman dan investasi. Perusahaan ini juga menaungi Stratolaunch, perusahaan yang menghasilkan pesawat terbesar di dunia.
Selain mendirikan berbagai perusahaan, Paul Allen juga masih terdaftar sebagai dewan direksi Microsoft hingga November 2000. Soal jumlah kekayaan yang dimiliki, Paul Allen masih menduduki peringkat ke-21 sebagai orang terkaya di dunia hingga Senin lalu.
Paul Allen kembali dirawat karena penyakit yang dideritanya pada awal Oktober 2018. Sebagai orang yang telah berkontribusi besar dalam dunia teknologi dan sosial, kepergiannya menimbulkan dukacita yang cukup mendalam.