Plot utama dari drama Hierarchy adalah kasus kematian misterius seorang siswa bernama Kang In Han (Kim Min Chul) di SMA Jooshin. Di episode perdananya saja penonton sudah diajak menyaksikan ketegangan yang terjadi di dalamnya. Di mana semua orang tampak sebagai tersangka karena dianggap bungkam atas kasus tersebut.
Sampai akhirnya datang Kang Ha (Lee Chae Min) yang merupakan adik dari Kang In Han. Ia juga menjadi penerima beasiswa di SMA Jooshin, tapi punya misi lain berkaitan dengan kematian sang kakak. Ini dia tujuh cara yang dilakukan Kang Ha untuk mengungkap misteri kematian kakaknya di drakor Hierarchy.