Izan Guevara langsung memimpin balapan setelah memulai dari posisi pertama. Sementara itu, Manuel Gonzalez yang berada di posisi start ketiga harus memulai balapan dari pit lane karena motornya sempat mogok di grid.
Di sisi lain, Tony Arbolino yang merangsek ke posisi kedua setelah berada di posisi start kelima terus membayangi Guevara. Pembalap Fantic Racing itu mencari kesempatan merebut posisi terdepan. Arbolino sempat melakukan manuver menyalip pada lap 17, tetapi melebar sehingga kembali ke posisi kedua.
Sementara itu, kedudukan Guevara tidak tergoyahkan hingga akhir balapan. Pembalap bernomor motor 28 itu finis dengan keunggulan 0,419 detik atas Arbolino. Ini menjadi kemenangan ketiga Guevara di Moto2 2026. Sebelumnya, ia naik podium tertinggi di GP Prancis dan Austria.
Guevara merupakan pembalap ke-14 yang memenangi balapan Moto2 di Sirkuit Motegi sejak kelas balap tersebut bergulir pada 2010. Thomas Luthi tetap memegang status sebagai pembalap peraih kemenangan terbanyak lewat dua kemenangan. Deretan pembalap Moto2 yang berhasil finis terdepan di GP Jepang berdasarkan data Forix per 4 Oktober 2026 dapat dilihat dalam daftar berikut:
Thomas Luthi - 2 kemenangan;
Toni Elias - 1 kemenangan;
Andrea Iannone - 1 kemenangan;
Marc Marquez - 1 kemenangan;
Pol Espargaro - 1 kemenangan;
Johann Zarco - 1 kemenangan;
Alex Marquez - 1 kemenangan;
Francesco Bagnaia - 1 kemenangan;
Luca Marini - 1 kemenangan;
Ai Ogura - 1 kemenangan;
Somkiat Chantra - 1 kemenangan;
Manuel Gonzalez - 1 kemenangan;
Daniel Holgado - 1 kemenangan;
Izan Guevara - 1 kemenangan.