Jagat Naruto dipenuhi dengan berbagai ninja baik dan jahat. Lima negara besar shinobi yang juga sering saling perang membuat jutsu-jutsu berkembang liar, mengikuti keinginan besar penggunanya untuk menang.
Bahkan, beberapa ninja menguasai jutsu yang gelap dan terlarang. Untuk memakai jutsu ini, diperlukan pengorbanan yang gak main-main.
Merupakan jutsu penyegelan paling kuat, pengguna jutsu ini harus mengorbankan nyawanya sendiri untuk menyegel jiwa lainnya.
Ibiki Morino menjadi karakter yang sulit dilupakan setelah ia mengeluarkan jutsu pemanggil yang disebut Torture Chamber.
Jutsu ini dapat menyandera dan menyiksa musuhnya secara brutal. Untuk memakai jutsu ini, penggunanya juga harus merasakan kesakitan yang sama seperti yang ia berikan kepada korban.
Jutsu ini dikuasai oleh Rock Lee dan Might Guy. Saat berduel dengan Gaara selama ujian chunin, Lee telah membuka lima gerbang pertama. Hasilnya, ia cedera parah hingga terancam tak bisa melanjutkan menjadi ninja.
Setelah itu, Might Guy membuka gerbang keenam hingga kedelapan. Jika bukan karena bantuan Naruto dan Tsunade, mungkin cedera yang dialami Lee dan Guy bakal lebih parah.
Tsukuyomi membuat korbannya berada di bawah ilusi. Penglihatan, pendengaran, dan berbagai macam hal lainnya di bawah kendali pengguna jutsu.
Korbannya biasanya sampai harus koma dan mengalami trauma berlarut-larut. Sementara penggunanya akan sangat dilemahkan setelah menggunakan jutsu ini.
Tsuchikage menguasai jutsu kuat bernama Atomic Dismantling Jutsu. Jutsu ini bisa menghancurkan apa pun yang ditangkapnya menjadi debu juga merobek material hingga tingkat molekuler.
Jutsu ini harus dikeluarkan dengan Mangekyo Sharingan. Api hitam yang dikeluarkan oleh jutsu ini bisa membakar apapun sampai tidak ada yang tersisa.
Namun, pengguna jutsu ini harus mengorbankan mata dan penglihatannya. Paling parah, efeknya adalah buta.
Memanfaatkan benang chakra untuk mengontrol tubuh boneka yang bisa diandalkan dalam pertempuran terlihat seperti jutsu biasa.
Namun jutsu yang diperlihatkan Kankuro tampak lebih menyeramkan. Ia bisa mengubah mayat anggota Akatsuki yang tewas, menjadi boneka yang kuat.
Seperti yang dimiliki Sasuke, pengguna jutsu ini akan meninggalkan segel di tubuh korbannya. Dengan segel itu, ia bisa memengaruhi pikiran dan kehendak korbannya.
Jutsu yang dikuasai Deidara ini bisa menanamkan chakra ke tanah, dan mengubahnya menjadi bom eksplosif macam C4.
Jutsu C4 ini menyerang targetnya dengan menjadi potongan-potongan kecil yang akan menempel ke sel darah lawan.
Salah satu jutsu paling gelap dan tabu dilakukan. Dikuasai oleh Orochimaru, jutsu ini bisa membangkitkan lagu ninja yang sudah mati.
Ninja itu akan dikendalikan oleh pemilik jutsunya. Memanipulasi gerakannya seperti yang dia inginkan.
Jutsu-jutsu tergelap ini punya kontroversi tersendiri di jaagat Naruto. Beberapa bahkan sebenarnya terlarang dan tabu untuk digunakan.