Berbeda dengan Tamers yang latarnya kebanyakan berada di dunia nyata, seri keempat berjudul Digimon Frontier ini seperti kembali ke formula awal. Menceritakan lima anak terpilih bernama Kanbara Takuya, Minamoto Koji, Shibayama Junpei, Orimoto Izumi, dan Himi Tomoki yang dipanggil ke dunia digital oleh salah satu dari tiga Celestial Angels, yaitu Ophanimon, melalui telepon seluler mereka.
Kelimanya bertemu dengan Bokomon dan Neemon yang kemudian jadi pemandu di dunia digital. Telepon seluler mereka berubah menjadi D-Scanner alias digivice versi Digimon Frontier. Misi utama mereka adalah membebaskan Ophanimon dan Seraphimon dengan mengalahkan Cherubimon.
Namun, seperti biasa, waralaba Digimon selalu berusaha menghadirkan yang baru. Pada seri yang berjumlah 50 episode ini tidak ada partner Digimon. Para anak terpilihlah yang berevolusi dan bertarung dengan bentuk Digimon.