Gus Dur (Wikimedia/National Information and Communication AgencyRepublic of Indonesia - K.H. Abdurrahman Wahid: President of the Republic of Indonesia)
Said dikenal sebagai salah satu sosok yang akrab dengan Presiden ketiga, Abdurrahman Wahid atau Gus Dur. Ketika Said menempuh pendidikan di Saudi, Gus Dur sering berkunjung ke rumahnya.
"Gus Dur sering berkunjung ke kediaman kami. Meski pada waktu itu rumah kami sangat sempit, akan tetapi Gus Dur menyempatkan untuk menginap di rumah kami. Ketika datang, Gus Dur berdiskusi sampai malam hingga pagi dengan Bapak," ucap Muhammad Said.
Selain itu, Gus Dur juga sering mengajak Said untuk sowan ke sejumlah ulama besar di Arab Saudi. Setelah selesai menempuh pendidikan S3 di Saudi, Said kemudian pulang ke tanah air. Gus Dur merupakan tokoh yang mengajak Said untuk aktif di PBNU.
Pada Muktamar ke-29 di Cipasung, Gus Dur memasukkan nama Said sebagai Wakil Katib 'Aam PBNU. Kala itu, Gus Dur juga sering memuji kualitas Said.
“Dia (Said Aqil) doktor muda NU yang berfungsi sebagai kamus berjalan dengan disertasi lebih dari 1.000 referensi,” demikian puji tokoh bangsa yang dimakamkan di Jombang, Jawa Timur.