Setelah pensiun dari NBA pada 2003, John Stockton tetap aktif dalam dunia basket pada awal masa istirahatnya. Dia sering terlihat dalam acara-acara NBA dan menjadi inspirasi bagi pemain muda. Stockton juga pernah menjabat sebagai asisten pelatih Montana State University. Dia senang berbagi pengetahuannya tentang permainan kepada generasi yang ada saat itu.
Meski jauh dari sorotan karena pensiun, Stockton tetap terlibat dalam berbagai kegiatan amal dan komunitasnya. Dia menggunakan kepopulerannya untuk melakukan sesuatu. Stockton pun dikenal sebagai pribadi yang rendah hati dan selalu siap membantu mereka yang membutuhkan. Warisan dan dedikasinya terhadap olahraga basket tetap dikenang banyak orang lewat berbagai aktivitasnya di luar lapangan.
Berkat dedikasinya, Stockton sendiri mendapat penghormatan dari Utah Jazz dan Gonzaga University. Nomor punggungnya (12) dipensiunkan mereka. Nomor 12 Jazz dan Gonzaga Bulldogs pun tidak akan bisa dipakai pemain lain tanpa seizin Stockton.
John Stockton salah satu pemain NBA yang paling dihormati dan diakui sepanjang masa. Punya rekor assist dan steal yang tidak tertandingi serta dedikasi dan kerja keras yang luar biasa, dia mampu mengukir namanya dalam sejarah permainan ini. Penghargaan dan pencapaiannya tidak hanya menjadi bukti dari bakat dan ketekunannya, tetapi juga inspirasi bagi banyak orang di seluruh dunia. Sebagai legenda hidup, John Stockton akan selalu dikenang sebagai pemain yang memberikan kontribusi besar bagi perkembangan basket.